Caracterización de ácidos nucleicos mediante electroforesis en geles
Introducción
La electroforesis en gel es una técnica utilizada comúnmente en la nanobiología para la separación y la caracterización de ácidos nucleicos. El ADN y el ARN son los dos tipos principales de ácidos nucleicos presentes en las células, y el análisis de su tamaño y carga puede proporcionar información valiosa sobre la estructura y función celular. La electroforesis en gel se basa en la carga eléctrica de las moléculas, que se desplazan a través de un gel poroso cuando se les aplica un campo eléctrico. La separación se produce debido a la diferencia en la velocidad que cada molécula se mueve a través del gel.
Técnica de electroforesis en gel
La electroforesis en gel se realiza típicamente utilizando un gel de agarosa o poliacrilamida, que se coloca dentro de un electrophorético. El electrophorético es una caja con electrodos colocados en los extremos de la caja, que se utilizan para aplicar el campo eléctrico. El gel se prepara mezclando agarosa o poliacrilamida con tampón de electroforesis y se vierte en el electrophorético para solidificar. Una vez que el gel se ha solidificado, se realizan orificios en la parte superior del gel, que se utilizan para cargar las muestras.
Las muestras se mezclan con un tampón de carga que contiene colorante de carga y se cargan en los orificios del gel utilizando una micropipeta. Una vez que las muestras están en su lugar, se aplica el campo eléctrico y las moléculas cargadas se desplazan a través del gel. El tamaño de las moléculas determina la velocidad a la que viajan a través del gel, lo que resulta en la separación de las moléculas por tamaño. Después del tiempo de ejecución apropiado, el gel se retira del electrophorético y se tiñe con un colorante para visualizar las bandas que han sido separadas.
Gel de agarosa vs. gel de poliacrilamida
El agarosa se utiliza comúnmente para separar moléculas de ADN de alta masa molecular, mientras que la poliacrilamida se utiliza para separar moléculas de menor tamaño, como el ARN y el ADN de un solo filamento. El agarosa es un gel más grueso con una malla porosa más grande que la poliacrilamida, lo que permite la separación de moléculas de mayor tamaño. La poliacrilamida es un gel más fino con una malla porosa más pequeña que la agarosa, lo que permite la separación de moléculas de menor tamaño.
Tipos de electroforesis en gel
Existen varios tipos diferentes de electroforesis en gel que se utilizan para diferentes propósitos. La electroforesis en gel de agarosa es la variante más común y se utiliza para separar moléculas de ADN de alta masa molecular. La electroforesis en gel de poliacrilamida se utiliza para analizar pequeñas moléculas de ADN o ARN. La electroforesis en gel nativo se utiliza para separar moléculas sin desnaturalizar su estructura tridimensional, mientras que la electroforesis en gel desnaturalizante se utiliza para romper la estructura tridimensional de las moléculas y separarlas por tamaño.
Aplicaciones de la electroforesis en gel
La electroforesis en gel tiene muchas aplicaciones diferentes en la nanobiología. Por ejemplo, la electroforesis en gel se utiliza para confirmar la presencia o ausencia de material genético en una muestra, lo que es importante para el diagnóstico de enfermedades genéticas. La electroforesis en gel también se utiliza para caracterizar diferentes isoformas de una proteína, lo que puede ser útil para la identificación de nuevos medicamentos y terapias. Además, la electroforesis en gel se utiliza para la clonación de genes y la secuenciación del ADN.
Conclusiones
En resumen, la electroforesis en gel es una técnica poderosa y ampliamente utilizada en la nanobiología para la separación y la caracterización de ácidos nucleicos. La técnica se basa en la carga eléctrica de las moléculas, lo que permite la separación de las moléculas por tamaño y carga. La electroforesis en gel se realiza típicamente utilizando un gel de agarosa o poliacrilamida y puede utilizarse para separar moléculas de ADN o ARN. La electroforesis en gel tiene numerosas aplicaciones en la nanobiología, incluyendo el diagnóstico de enfermedades genéticas, la identificación de nuevos medicamentos y terapias, y la clonación y secuenciación de genes.